{"id":2559,"date":"2022-03-11T11:07:07","date_gmt":"2022-03-11T10:07:07","guid":{"rendered":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/?post_type=temoignage&p=2559"},"modified":"2022-03-11T14:02:14","modified_gmt":"2022-03-11T13:02:14","slug":"sebastian-metz-bioinformaticien","status":"publish","type":"temoignage","link":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformaticien\/","title":{"rendered":"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d’infection des parasites chez les palourdes"},"content":{"rendered":"\n
\n

Le Dr Sebastian Metz est un bioinformaticien qui a rejoint la Station Biologique de Roscoff<\/a> en janvier 2022 pour travailler sur son projet \u00ab\u00a0PACTO\u00a0\u00bb.<\/p>\n

Equipe BIENVEN\u00dcE\u00a0: Comment avez-vous commenc\u00e9 \u00e0 vous int\u00e9resser \u00e0 votre domaine de recherche ?<\/strong><\/p>\n

Dr Sebastian Metz\u00a0: Depuis ma licence en bioinformatique, je m’int\u00e9resse \u00e0 l’\u00e9tude de la biologie des organismes par des approches g\u00e9nomiques (c’est-\u00e0-dire en \u00e9tudiant l’ADN). Pendant mon doctorat, j’ai \u00e9tudi\u00e9 la diversit\u00e9 des protistes et leurs relations avec l’environnement en utilisant des m\u00e9thodes mol\u00e9culaires et g\u00e9nomiques. Les protistes sont des microorganismes eucaryotes unicellulaires. La plupart d’entre eux sont microscopiques mais extraordinairement complexes et tr\u00e8s importants pour les \u00e9cosyst\u00e8mes.<\/p>\n

En apprenant \u00e0 mieux conna\u00eetre la diversit\u00e9 de ces organismes, \u00e0 la fin de mon doctorat, j’ai termin\u00e9 avec plus de questions que de r\u00e9ponses. Par exemple, que font ces organismes ? Quelles sont leurs fonctions dans les \u00e9cosyst\u00e8mes ? Comment interagissent-ils ? Et comment ces interactions peuvent-elles nous en apprendre davantage sur le \u00ab\u00a0bien-\u00eatre\u00a0\u00bb de l’\u00e9cosyst\u00e8me ? Comment les protistes \u00e9voluent-ils et s’adaptent-ils au changement climatique ?<\/p>\n

\u00c0 cet \u00e9gard, les parasites sont de bons exemples \u00e0 \u00e9tudier. Bien que nous soyons tous habitu\u00e9s \u00e0 penser que les parasites sont mauvais, ils sont essentiels \u00e0 tous les \u00e9cosyst\u00e8mes. En effet, il a \u00e9t\u00e9 propos\u00e9 qu’un \u00e9cosyst\u00e8me sain est un \u00e9cosyst\u00e8me riche en esp\u00e8ces parasites, car les parasites r\u00e9gulent les interactions et maintiennent la biodiversit\u00e9. Cependant, ceux-ci sont affect\u00e9s par le changement global et les pressions relatives \u00e0 l\u2019activit\u00e9 humaine. Par cons\u00e9quent, si, par exemple, un parasite envahit un nouvel environnement en r\u00e9ponse au changement global et r\u00e9ussit \u00e0 \u00e9tablir une nouvelle infection, cela aura des cons\u00e9quences sur la biodiversit\u00e9 locale. Cependant, il reste encore beaucoup \u00e0 \u00e9tudier pour comprendre ces processus et leurs effets potentiels.<\/p>\n

Pouvez-vous expliquer le projet PACTO en quelques mots ?<\/strong><\/p>\n

Dans PACTO, nous int\u00e9grerons des approches mol\u00e9culaires et bioinformatiques pour comprendre comment la communaut\u00e9 symbiotique (c’est-\u00e0-dire les organismes vivant dans un h\u00f4te) interagit avec un parasite pendant le processus d’infection. L’hypoth\u00e8se est que cette communaut\u00e9 joue un r\u00f4le essentiel dans la virulence et les maladies provoqu\u00e9es par un protiste parasite exotique.<\/p>\n

Dans ce projet, nous allons \u00e9tudier un parasite nomm\u00e9 P. olseni, responsable du d\u00e9clin de la population de palourdes et class\u00e9 comme maladie \u00e0 d\u00e9claration obligatoire par l’Organisation mondiale de la sant\u00e9 animale. En effet, P. olseni est un exemple de parasite envahisseur. Il a \u00e9t\u00e9 introduit en Europe avec son h\u00f4te, la palourde japonaise, pour le d\u00e9veloppement de l’aquaculture dans les ann\u00e9es 1970. Apr\u00e8s cet \u00e9v\u00e9nement malheureux, il s’est \u00e9tendu le long du littoral europ\u00e9en, produisant des \u00e9v\u00e9nements de mortalit\u00e9 massive de l’h\u00f4te et de l’esp\u00e8ce indig\u00e8ne (Ruditapes decussatus) en Espagne, au Portugal et en Italie.<\/p>\n

Ici, en France, la pr\u00e9valence du parasite est tr\u00e8s faible. Cependant, on s’attend \u00e0 ce qu’elle augmente en raison du r\u00e9chauffement climatique, ce qui affectera la diversit\u00e9 des bivalves dans la r\u00e9gion. Ce projet nous permettra de mieux comprendre le processus d’infection par le parasite et de g\u00e9n\u00e9rer des informations pour d\u00e9velopper de nouveaux outils de surveillance et de pr\u00e9vention de sa propagation.<\/p>\n

Pourquoi avez-vous choisi de venir en Bretagne ?<\/strong><\/p>\n

Apr\u00e8s mon doctorat, j’avais envie d’\u00e9tudier la fonction et la relation des parasites protistes avec l’\u00e9cosyst\u00e8me. J’ai eu l’opportunit\u00e9 d’int\u00e9grer le LEMAR \u00e0 Brest pour travailler avec les Dr Aurelie Chambouvet et Evelyne Derelle, et j’ai accept\u00e9. Le projet consistait \u00e0 \u00e9tudier les g\u00e9nomes et les transcriptomes de P. olseni et P. chesapeaki, deux parasites dont on a observ\u00e9 qu’ils co-infectaient les m\u00eames palourdes. Le s\u00e9quen\u00e7age g\u00e9nomique nous donne des informations sur le contenu en ADN des parasites, tandis que la transcriptomique nous renseigne sur les mol\u00e9cules sp\u00e9cifiques qui sont exprim\u00e9es et participent \u00e0 diff\u00e9rents processus. La combinaison des deux techniques nous permet de comprendre les m\u00e9canismes des infections.<\/p>\n

C’est pendant mon s\u00e9jour au LEMAR que le projet PACTO a vu le jour. Ce projet est li\u00e9 \u00e0 d’autres projets r\u00e9cemment financ\u00e9s impliquant des collaborations avec des experts dans le domaine de la recherche en France, en Espagne, en Italie et au Royaume-Uni. D’autre part, nous avons r\u00e9cemment d\u00e9m\u00e9nag\u00e9 \u00e0 la Station Marine de Roscoff, une institution de premier plan dans le monde des sciences marines. Elle dispose d’installations de pointe en g\u00e9nomique, n\u00e9cessaires au d\u00e9veloppement de ce projet. Tout cela cr\u00e9e un environnement parfait pour le d\u00e9veloppement du projet PACTO.<\/p>\n

Souhaitez-vous partager une ressource ou un ouvrage pour tous ceux qui souhaitent en savoir plus sur votre domaine ?<\/strong><\/p>\n

Si vous vous int\u00e9ressez aux parasites, je vous recommande vivement le livre \u00ab\u00a0l\u2019art d\u2019\u00eatre parasite\u00a0\u00bb de Claude Combes<\/a>, un biologiste et parasitologue fran\u00e7ais. Le livre pr\u00e9sente comment les parasites ont \u00e9volu\u00e9 pour survivre et leurs strat\u00e9gies d’infection.<\/p>\n

Merci S\u00e9bastien !<\/p>\n<\/div>\n<\/section>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"featured_media":2536,"template":"","class_list":["post-2559","temoignage","type-temoignage","status-publish","has-post-thumbnail","hentry"],"acf":[],"yoast_head":"\nSebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d'infection des parasites chez les palourdes · BIENVEN\u00dcE<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"fr_FR\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d'infection des parasites chez les palourdes · BIENVEN\u00dcE\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"BIENVEN\u00dcE\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2022-03-11T13:02:14+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:width\" content=\"1536\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:height\" content=\"2048\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:type\" content=\"image\/jpeg\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/\",\"url\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/\",\"name\":\"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d'infection des parasites chez les palourdes · BIENVEN\u00dcE\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/#website\"},\"primaryImageOfPage\":{\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#primaryimage\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#primaryimage\"},\"thumbnailUrl\":\"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg\",\"datePublished\":\"2022-03-11T10:07:07+00:00\",\"dateModified\":\"2022-03-11T13:02:14+00:00\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"fr-FR\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/\"]}]},{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"fr-FR\",\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#primaryimage\",\"url\":\"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg\",\"contentUrl\":\"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg\",\"width\":1536,\"height\":2048},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Home\",\"item\":\"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Temoignages\",\"item\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/temoignage\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":3,\"name\":\"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d’infection des parasites chez les palourdes\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/#website\",\"url\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/\",\"name\":\"BIENVEN\u00dcE\",\"description\":\"Welcoming talented international post-docs in Brittany.\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"fr-FR\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d'infection des parasites chez les palourdes · BIENVEN\u00dcE","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/","og_locale":"fr_FR","og_type":"article","og_title":"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d'infection des parasites chez les palourdes · BIENVEN\u00dcE","og_url":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/","og_site_name":"BIENVEN\u00dcE","article_modified_time":"2022-03-11T13:02:14+00:00","og_image":[{"width":1536,"height":2048,"url":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg","type":"image\/jpeg"}],"twitter_card":"summary_large_image","schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/","url":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/","name":"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d'infection des parasites chez les palourdes · BIENVEN\u00dcE","isPartOf":{"@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/#website"},"primaryImageOfPage":{"@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#primaryimage"},"image":{"@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#primaryimage"},"thumbnailUrl":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg","datePublished":"2022-03-11T10:07:07+00:00","dateModified":"2022-03-11T13:02:14+00:00","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#breadcrumb"},"inLanguage":"fr-FR","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/"]}]},{"@type":"ImageObject","inLanguage":"fr-FR","@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#primaryimage","url":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg","contentUrl":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/app\/uploads\/2022\/02\/photo_metz.jpeg","width":1536,"height":2048},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/sebastian-metz-bioinformatician\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Temoignages","item":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/temoignage\/"},{"@type":"ListItem","position":3,"name":"Sebastian Metz, bioinformaticien, travaille sur le processus d’infection des parasites chez les palourdes"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/#website","url":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/","name":"BIENVEN\u00dcE","description":"Welcoming talented international post-docs in Brittany.","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"fr-FR"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/temoignage\/2559","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/temoignage"}],"about":[{"href":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/temoignage"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/2536"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2559"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}