{"id":2534,"date":"2022-02-04T17:03:38","date_gmt":"2022-02-04T16:03:38","guid":{"rendered":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/?post_type=temoignage&p=2534"},"modified":"2022-02-04T17:03:39","modified_gmt":"2022-02-04T16:03:39","slug":"trinetra-mukherjee-microbiologiste","status":"publish","type":"temoignage","link":"https:\/\/bienvenue.bretagne.bzh\/fr\/temoignage\/trinetra-mukherjee-microbiologiste\/","title":{"rendered":"Trinetra Mukherjee, microbiologiste, travaille sur les microbes vivant dans des conditions extr\u00eames"},"content":{"rendered":"\n
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Dr Trinetra Mukherjee est une microbiologiste qui travaille sur les micro-organismes vivant dans des environnements extr\u00eames au sein du laboratoire BEEP<\/a> de l’Universit\u00e9 de Bretagne Occidentale<\/a>. Son projet \u00ab\u00a0PIEZOPRO\u00a0\u00bb a d\u00e9but\u00e9 en janvier dernier.<\/p>\n

[Equipe BIENVEN\u00dcE]Bonjour Trinetra, comment avez-vous commenc\u00e9 \u00e0 vous int\u00e9resser \u00e0 votre domaine de recherche ?<\/strong><\/p>\n

[Dr Trinetra Mukherjee] J’ai fait mon master et mon doctorat en microbiologie et je me suis int\u00e9ress\u00e9e aux extr\u00eamophiles. Il s’agit de micro-organismes qui vivent confortablement dans des conditions que nous, les humains, consid\u00e9rons comme extr\u00eames, telles que les hautes temp\u00e9ratures et les hautes pressions. Par exemple, pour nous il est difficile de vivre \u00e0 50 ou 60\u00b0C, mais eux appr\u00e9cient vivre \u00e0 des temp\u00e9ratures et des pressions plus \u00e9lev\u00e9es telles que 80 ou 90\u00b0 !<\/p>\n

Mon objectif de carri\u00e8re est de travailler sur la caract\u00e9risation physiologique des microorganismes extr\u00eamophiles et sur le d\u00e9veloppement de produits d\u00e9riv\u00e9s qui pourraient avoir un certain potentiel environnemental, industriel et biotechnologique. Au cours de mon Master et de mon Doctorat, j’ai travaill\u00e9 sur les organismes thermophiles, c’est-\u00e0-dire les organismes qui se d\u00e9veloppent \u00e0 des temp\u00e9ratures \u00e9lev\u00e9es, isol\u00e9s des sources chaudes de l’Inde. Je me suis concentr\u00e9e sur les bact\u00e9ries thermophiles ayant des caract\u00e9ristiques favorisant la croissance des plantes, les producteurs de carot\u00e9no\u00efdes et les producteurs d’enzymes thermostables.<\/p>\n

Sur quels sujets allez-vous enqu\u00eater au cours du projet PIEZOPRO ?<\/strong><\/p>\n

Je veux maintenant \u00e9largir mes comp\u00e9tences et travailler sur d’autres extr\u00eamophiles. L’environnement marin est un milieu tr\u00e8s particulier. Il y a des endroits o\u00f9 la mer est tr\u00e8s froide, avec peu d’oxyg\u00e8ne, beaucoup de de sel et une tr\u00e8s forte pression. De m\u00eame, il y a les chemin\u00e9es hydrothermales, des r\u00e9gions des profondeurs marines o\u00f9 de l’eau sans oxyg\u00e8ne, chaude et chimiquement riche est lib\u00e9r\u00e9e dans les oc\u00e9ans froids environnants par des fissures dans le fond marin, similaire \u00e0 des volcans sous-marins. Je m’int\u00e9resse particuli\u00e8rement aux microbes qui vivent dans des conditions de pression hydrostatique \u00e9lev\u00e9e dans les chemin\u00e9es hydrothermales des grands fonds marins, les \u00ab\u00a0pi\u00e9zophiles\u00a0\u00bb.<\/p>\n

Comment survivent-ils dans de telles conditions ?<\/strong><\/p>\n

Le projet utilise le microorganisme Thermococcus barophilus<\/em> comme mod\u00e8le pi\u00e9zophile. Je vais me concentrer sur un aspect important, \u00e0 savoir comment cet organisme acquiert les acides amin\u00e9s n\u00e9cessaires \u00e0 sa survie \u00e0 haute pression. Les acides amin\u00e9s sont un \u00e9l\u00e9ment cl\u00e9 en biologie, car ils jouent un r\u00f4le important dans les processus biologiques cellulaires tels que le m\u00e9tabolisme. Les chercheurs ont constat\u00e9 que chez Thermococcus barophilus<\/em>, la haute pression r\u00e9prime de nombreuses voies de biosynth\u00e8se, de production des acides amin\u00e9s. Cela devrait donc r\u00e9duire les chances de survie, \u00e0 moins que le microorganisme ne d\u00e9veloppe un m\u00e9canisme pour combler cette carence en acides amin\u00e9s. Je veux comprendre quelles enzymes (prot\u00e9ases) peuvent \u00eatre utiles pour acqu\u00e9rir les acides amin\u00e9s n\u00e9cessaires \u00e0 la survie dans ces conditions. Je travaillerai \u00e0 l’interface de la microbiologie, de la g\u00e9n\u00e9tique, des omiques et de la bio-informatique pour \u00e9tudier ce ph\u00e9nom\u00e8ne. Cela devrait nous aider \u00e0 comprendre un aspect important de la survie des pi\u00e9zophiles. C’est l’aspect fondamental de mon projet de recherche.<\/p>\n

PIEZOPRO a \u00e9galement un aspect appliqu\u00e9. <\/strong><\/p>\n

Le processus que j’\u00e9tudie pourrait \u00eatre tr\u00e8s int\u00e9ressant pour des industries telles que le papier, le textile, l’industrie pharmaceutique, etc. L’industrie a besoin d’enzymes capables d’effectuer plusieurs processus dans des conditions plus difficiles, par exemple \u00e0 des pressions et des temp\u00e9ratures \u00e9lev\u00e9es. Les enzymes produites dans des conditions \u00ab\u00a0normales\u00a0\u00bb, non adapt\u00e9es ou tol\u00e9rantes \u00e0 la chaleur ou \u00e0 la pression, ne sont pas stables et peuvent \u00eatre d\u00e9grad\u00e9es au cours du processus. Si nous utilisons des enzymes provenant d’extr\u00eamophiles, il y a plus de chances qu’elles soient plus stables face \u00e0 la chaleur ou \u00e0 la pression. C’est ainsi que mon projet contribue \u00e0 la strat\u00e9gie r\u00e9gionale pour le d\u00e9veloppement des biotechnologies marines.<\/a><\/p>\n

Pr\u00e9voyez-vous des collaborations en dehors de votre laboratoire ?<\/strong><\/p>\n

Oui, je vais visiter le laboratoire ELMA<\/a> \u00e0 Grenoble pour utiliser leurs instruments de haute technologie pendant environ 4 mois. En particulier, je vais purifier les enzymes, c’est-\u00e0-dire les isoler des extraits cellulaires bruts contenant de nombreux autres composants ind\u00e9sirables, et je vais \u00e9galement les caract\u00e9riser et \u00e9tudier leur structure, leur cin\u00e9tique et leur stabilit\u00e9. Je b\u00e9n\u00e9ficie d’une collaboration de longue date entre le laboratoire BEEP et celui d\u2019ELMA. Il s’agit d’un centre de recherche internationalement reconnu dans ce domaine, qui a explor\u00e9 la dynamique des prot\u00e9ines pour \u00e9tudier des ph\u00e9nom\u00e8nes biologiques tels que l’adaptation des mol\u00e9cules \u00e0 des environnements extr\u00eames.<\/p>\n

C’est votre premier poste de longue dur\u00e9e \u00e0 l’\u00e9tranger, apr\u00e8s une ann\u00e9e \u00e0 l’Universit\u00e9 de la Ruhr de Bochum (Allemagne). Pourquoi avez-vous choisi de venir en Bretagne ?<\/strong><\/p>\n

Comme j\u2019ai d\u00e9j\u00e0 pu l\u2019expliquer, je cherchais \u00e0 \u00e9largir mes comp\u00e9tences en mati\u00e8re d’extr\u00eamophiles et je voulais travailler sur les extr\u00eamophiles des chemin\u00e9es d’eau profonde. Mon actuel directeur de th\u00e8se, Mohamed Jebbar, est l’un des meilleurs scientifiques dans ce domaine et je l’ai donc contact\u00e9. J’\u00e9tais \u00e9galement \u00e0 la recherche de bourses du MSCA, et c’est ainsi que BIENVEN\u00dcE a \u00e9t\u00e9 l’occasion. J’en ai entendu parler par le site internet de l’ISBlue, une graduate school<\/em> sp\u00e9cialis\u00e9e dans les sciences et technologies marines.<\/p>\n

Je tiens \u00e0 ajouter que l’emplacement de mon laboratoire \u00e0 Plouzan\u00e9, pr\u00e8s de l’oc\u00e9an, est vraiment agr\u00e9able. C’est assez motivant de voir la mer tous les jours, surtout quand on travaille sur ce qui se passe dans ses profondeurs.<\/p>\n

Avez-vous une recommandation \u00e0 faire \u00e0 ceux qui veulent en savoir plus sur vos recherches ?<\/strong><\/p>\n

Si vous \u00eates int\u00e9ress\u00e9 par les pi\u00e9zophiles, je vous recommande les vid\u00e9os suivantes de mon superviseur : une introduction aux \u00e9cosyst\u00e8mes des grands fonds<\/a> (en anglais), une autre vid\u00e9o sur les pi\u00e9zophiles<\/a> (en fran\u00e7ais). Le site internet Astrobioeducation<\/a> (en fran\u00e7ais) est \u00e9galement une bonne ressource pour en savoir plus.<\/p>\n

Les lecteurs qui sont int\u00e9ress\u00e9s par mes travaux de recherche en g\u00e9n\u00e9ral sur les extr\u00eamophiles peuvent \u00e9galement suivre mon site internet<\/a>.<\/p>\n

Merci Trinetra\u00a0!<\/strong><\/p>\n<\/div>\n<\/section>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"featured_media":2519,"template":"","class_list":["post-2534","temoignage","type-temoignage","status-publish","has-post-thumbnail","hentry"],"acf":[],"yoast_head":"\nTrinetra Mukherjee, microbiologiste, travaille sur les microbes vivant dans des conditions extr\u00eames · BIENVEN\u00dcE<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/msca-bienvenue.bretagne.bzh\/temoignage\/trinetra-mukherjee-microbiologist\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"fr_FR\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Trinetra Mukherjee, microbiologiste, travaille sur les microbes vivant dans des conditions extr\u00eames · BIENVEN\u00dcE\" \/>\n<meta property=\"og:url\" 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